肛裂多由血热肠燥，大便秘结，排便过于用力，使肛门皮肤破裂，反复而发病。《医宗金鉴·外科心法要诀》中说：“肛门围绕，折纹破裂，便结者，火燥也。”扼要阐述了因热结肠燥，或因阴虚津亏而致大便秘结，排便用力，使肛门皮肤裂伤，随后又继发感染，逐渐形成慢性、梭形溃疡。但也有因肛管狭窄、肛门湿疹、痔疮损伤等感染而发病。北京东大肛肠医师讲道，肛裂的发生主要与下列因素有关：
１．解剖学因素：肛门外括约肌浅部，从尾骨起，向前至肛门后方。分为两束，沿肛管两侧向前围绕，至肛门前方，又相互联合。因此，在肛门前后都留有间隙。并且肛提肌的大部分均附着于肛管两侧，前后较少。可见，肛门前、后方不如两侧牢固，容易受损伤。并且向下、向后与直肠形成一近９０度的角。因此，肛门后部受粪便压迫较重，又因肛管后部血液循环不足，弹性较差，肛门腺分布又较多，这些都是发生肛裂的因素。
２．外伤学说：干硬的粪便或异物容易引起肛管皮肤的损伤，这是引起肛裂的主要因素。
３．感染学说：主要是肛门后部的肛隐窝感染，炎症向肛管皮下部蔓延，致使皮下脓肿破溃而成肛裂。
４．内括约肌痉挛学说：由于肛管部位损伤或炎症刺激，使肛门括约肌处于痉挛状态，致使肛管张力增强，易损伤成肛裂。
５．肛门狭小学说：肛管皮肤在发育中迟缓，生成肛管狭小，易损伤成肛裂。
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